预付款和履约保函在工程承包中都是作为履约保证措施的两种常见方式，但两者之间存在显著区别。
**预付款**是一种资金支付方式，指发包人在合同签订后向承包人预先支付一定比例的合同价款，作为承包人启动工程、购买材料和支付人工费用的资金来源。
**履约保函**是一种由银行或保险公司出具的担保文件，保证承包人在合同约定期限内按照合同要求履行其义务，如未按期或按质完成工程，担保机构将按照保函约定向发包人承担赔偿责任。
预付款的主要目的是为承包人提供启动资金，确保工程顺利开工，同时也是对承包人资信和履约能力的考察。发包人通过提供预付款，可以促使承包人加快工程进度，也方便发包人掌控工程资金流向。
履约保函主要的目的是为发包人提供履约保障，避免因承包人违约或无力履行合同义务给发包人造成的经济损失。通过要求承包人提供履约保函，发包人可以保证工程顺利完工，并降低项目风险。
预付款一般适用于承包商信誉良好、资信雄厚的大型项目，发包人对承包人的履约能力有充分的信任。履约保函则**适用于各类工程项目，尤其是在承包商资信不足、工程风险较大的情况下，发包人通常会要求承包人提供履约保函作为保障。
**预付款**的办理流程相对简单，发包人在合同中约定预付款支付比例和条件，承包人收到预付款后需出具担保函，承诺将预付款用于工程。履约保函的办理流程较为复杂，承包人需向银行或保险公司提出保函申请，由担保机构对承包人的资信、履约能力和项目风险进行评估后决定是否出具保函。
**预付款**的法律效力取决于合同约定。发包人可根据合同约定，在承包人违约时从预付款中扣除违约金额。履约保函是一种独立于合同之外的担保文件，具有独立的法律效力。当承包人违约时，发包人可直接向担保机构索赔，不受合同规定的限制。
预付款的优点在于简化了办理流程，为承包人提供启动资金，缺点在于对承包人的履约能力要求较高，发包人存在预付款被挪用或承包人违约的风险。履约保函的优点在于为发包人提供了较高的履约保障，缺点在于办理手续繁琐，成本较高。
总的来说，预付款和履约保函是工程承包中两种不同的履约保证方式，其适用范围、办理流程、法律效力和优缺点各不相同。发包人应根据项目具体情况，综合考虑承包人的资信、项目风险和自身资金状况，合理选择合适的履约保证措施。
